Après avoir désinstaller et réinstallé DéjàDup, essayé de ne sauvegarder qu'un dossier isolé, vérifié l'état du disque dans Utilitaire de disques (Données SMART et auto-test) pour constater qu'il était sain, j'ai pu effectuer une sauvegarde complète sur un SSD externe.

A tout hasard, j'ai renommé le dossier de sauvegarde Backup en Backup.old et créé un dossier Backup vide, avant de relancer la sauvegarde qui s'est déroulée sans encombre jusqu'au bout, ce qui m'a permis de supprimer le Backup.old. Probablement qu'un des fichiers Duplicity qu'il contenait était corrompu...

Problème [Résolu] au bout de 2 heures. Mais j'aurais pu le résoudre en 2 minutes.